Apolipoproteiny jsou strukturní složky lipoproteinových částic, které se účastní syntézy, sekrece, zpracování a metabolismu lipoproteinů. Apolipoproteiny mají zásadní roli v metabolismu lipidů v krvi. Vady apolipoproteinu E (Apo E) jsou zodpovědné za familiární dysbetalipoproteinemii nebo hyperlipoproteinemii typu III, při které je zvýšený plazmatický cholesterol a triglyceridy výsledkem zhoršené clearance chylomikronu a zbytků lipoproteinů s velmi nízkou hustotou (VLDL).
> Lidský gen APOE je umístěn na chromozomu 19. 3 běžné alely APOE jsou označeny jako e2, e3 a e4, které kódují izoformy ApoE E2, E3 a E4. E3, nejběžnější izoforma u bělochů, vykazuje cystein (Cys) v aminokyselinové poloze 112 a arginin (Arg) v poloze 158. E2 a E4 se liší od E3 jednoduchými substitucemi aminokyselin v polohách 158 a 112 (E2: Arg158 – > Cys; E4: Cys112- > Arg). Frekvence alel pro většinu kavkazských populací jsou následující:
-e2 = 8% až 12%
-e3 = 74% až 78%
-e4 = 14% až 15%
E2 a E4 jsou spojeny s vyššími koncentracemi triglyceridů v plazmě. Více než 90% jedinců s hyperlipoproteinemií typu III je homozygotních pro alelu e2. Avšak < 10% jedinců homozygotních pro alelu e2 má zjevnou hyperlipoproteinemii typu III. To naznačuje, že k fenotypové expresi nemoci musí přispívat další genetické, hormonální nebo environmentální faktory. Alela e4 byla spojena s čistým zvýšením lipoproteinů s nízkou hustotou (LDL). Pacienti s lipidovým profilem shodným s hyperlipidemií typu III jsou kandidáty na analýzu jejich genotypu APOE.
Gen APOE je také známým genem citlivosti na Alzheimerovu chorobu. Alela e4 je spojena se zvýšeným rizikem Alzheimerovy choroby, zejména nemoci s pozdním nástupem, v závislosti na dávce. Na toto riziko mají vliv i další faktory. Odhaduje se, že jedinci s genotypem APOE e3 / e4 mají 4násobné relativní riziko Alzheimerovy choroby, zatímco homozygoti pro e4 alelu mají 12násobné relativní riziko. Několik studií naznačuje ochranný účinek alely APOE e2.
Alela APOE e4 však není dostatečná ani nutná pro rozvoj Alzheimerovy choroby.
Přibližně 50% jedinců s Alzheimerovou chorobou nese alelu e4 a mnoho jedinců, kteří mají alelu e4, Alzheimerovu chorobu nikdy nevyvine. Použití APOE analýzy pro prediktivní testování Alzheimerovy choroby není v současné době doporučeno American College of Medical Genetics kvůli omezené klinické použitelnosti a nízké prediktivní hodnotě.