Washington Wizards (2008–2012)
McGee byl Wizards v draftu NBA 2008 vybrán 18. celkově. 9. července 2008 podepsal dvouletou smlouvu s Wizards ve výši 2,4 milionu $.
McGee s Wizards v listopadu 2010
Dne 9. ledna 2010 dostal McGee od Wizards pokutu 10 000 $ za účast na dovádění Gilberta Arenase před zápasem 5. ledna 2010 proti Aréna byla vyšetřována kvůli předchozímu incidentu se zbraněmi v čarodějnické šatně, ale obvinění odlehčila tím, že ukázal prstem na své spoluhráče, jako by je střílel. Jeho spoluhráči byli s ním vyfotografováni, jak se usmívají a smějí se.
6. ledna 2011 byl McGee vybrán k účasti v soutěži NBA Slam Dunk Contest 2011. McGee byl prvním kouzelníkem, který se kdy zúčastnil soutěže. Skončil na druhém místě a podlehl Blake Griffinovi. McGee byl prvním hráčem, který použil tři míčky najednou v namočené soutěži, která byla později uvedena Guinnessovými světovými rekordy jako nejvíce basketbalových míčů namočených v jediném skoku. Třetí míč mu byl předán spoluhráčem Johnem Wallem.
15. března 2011, při ztrátě 98–79 proti týmu Chicago Bulls, McGee zaznamenal svůj první triple-double v kariéře, když zaznamenal 11 bodů, 12 doskoky a 12 bloků. Jeho kariéra s maximem 12 bloků byla nejvyšší od doby, kdy Keon Clark měl 23 23. března 2001. Dostal však určitou kritiku za to, že ve čtvrtém čtvrtletí pořídil neuvážené výstřely, aby zajistil, že dosáhl 10 bodů, zatímco byl jeho tým vyhozen, a dokonce dostal technickou chybu za nadměrnou oslavu tím, že se po namočení za své poslední body zatáhl za okraj. Televizní komentátor Kevin McHale to nazval „špatným triple-double“. V reakci na kritiku McGee řekl: „Dostal jsem trojnásobek. Kdo může říci, že dostal trojnásobek? Nemám z toho obavy.“
Během výluky NBA v roce 2011, Vedoucí představitelé NBPA se 14. října setkali s přibližně 30 hráči a zdůraznili jednotu. McGee schůzku opustil dříve a novinářům řekl, že někteří hráči „říkají, že jsou„ připraveni složit “, ale většina byla jednotná. McGee později popřel zmínku, že hráči byli připraveni složit, ale jeho komentář zaznamenali reportéři. Derek Fisher uvedl, že McGee „nemá schopnost učinit toto prohlášení“ na základě omezeného času, který na schůzce strávil.
McGee dosahoval v letech 2010–11 a 2011–12 průměrně více než 10 bodů a 8 doskoků u kouzelníků .
Denver Nuggets (2012–2015)
Dne 15. března 2012 byl McGee vyměněn za Nuggets spolu s Ronnym Turiafem v dohodě, která zaslala Nenê čarodějům. Jako člen kouzelníků zahájil 40 ze 41 her, ve kterých se objevil; s Nuggets by začal v 5 z 20 her, ve kterých se objevil. Jeho minuty by se také snížily, průměrně 27,4 s Washingtonem, 20,6 s Denverem. 21. března, ve svém debutu Nuggets, McGee udělal hru-vyhrávat namočit off Arron Afflalo minul volný hod s 5 sekund zbývá na hodiny. Na konci základní části Nuggets získali šesté semeno Západu a McGee se objevil v play-off NBA 2012, což bylo jeho první vystoupení v play-off v jeho kariéře. McGeeho nejvyšší hodnota v zápase 5 proti 21 bodům soupeř prvního kola Los Angeles Lakers. Počty McGeeho se v celé sérii zvyšovaly a snižovaly, včetně hry 7, když získal pouhých 6 bodů za střelu 1–7 za 32 minut podlahového času. 18. července 2012 McGee znovu podepsal smlouvu s Nuggets na čtyřech – rok, smlouva ve výši 44 milionů dolarů.
Sezóna 2013–14 McGee byla ukončena 20. února 2014, kdy podstoupil operaci k odstranění stresové zlomeniny levé holenní kosti, kterou utrpěl 8. listopadu 2013. .
29. října 2014 se McGee vrátil za Nuggets, když zaznamenal 2 body a 2 doskoky při výhře sezóny 89–79 nad Detroit Pistons.
Philadelphia 76ers (2015)
19. února 2015 byl McGee vyměněn spolu s právy na Chukwudiebere Maduabum a výběrem v prvním kole 2015 do týmu Philadelphia 76ers výměnou za práva na Cenk Akyol. 1. března 2015 byl 76ers vyloučen poté, co se objevil v šesti hrách.
Dallas Mavericks (2015–2016)
13. srpna 2015 podepsal McGee s Dallasem Mavericks. Zmeškal prvních 13 zápasů týmu v sezóně 2015–16 kvůli stresové zlomenině v levé holenní kosti. 22. listopadu 2015 debutoval u týmu Mavericks, hrál necelých 11 minut mimo lavičku a nahrával 8 bodů a 6 doskoků při prohře s Oklahoma City Thunder. 5. ledna 2016 zaznamenal sezónní maxima 13 bodů a 11 doskoků při výhře 117–116 v prodloužení nad Sacramento Kings.
8. července 2016 se Mavericks vzdali McGeeho.
Golden State Warriors (2016–2018)
16. září 2016 podepsal McGee smlouvu s Golden State Warriors. 15. prosince 2016 získal své letošní maximum 17 bodů za vítězství 103–90 nad New York Knicks.31. března 2017 měl 13 bodů a v sezóně nejlepších pět blokovaných střel při výhře 107–98 nad Houston Rockets. Warriors vyhráli mistrovství NBA 2017 poté, co ve finále NBA porazili Cleveland Cavaliers 4–1. Hrál v 77 z 82 zápasů základní části, s procento branek 0,652 a 16 ze 17 zápasů play-off, s procento 0,732, oba nejlepší ve své kariéře.
1. srpna V roce 2017 McGee podepsal s Warriors smlouvu na jeden rok. Jeho hrací doba se zvýšila, když byl po all-star přestávce zařazen do základní sestavy. V červnu 2018 vyhrál svůj druhý přímý šampionát poté, co Warriors porazili Cavaliers ve čtyřhře ve finále. Začal poslední tři zápasy série a ve čtyřech hrách dosáhl v průměru 8,0 bodu.
Los Angeles Lakers (2018–2020)
10. července 2018 podepsal McGee smlouvu s Los Angeles Lakers. V prosinci vynechal sedm her kvůli infekci dýchacích cest. 22. března 2019 dosáhl maxima kariéry 33 bodů a 20 doskoků spolu se šesti blokovanými střelami při ztrátě 111–106 na Brooklyn Nets.
Cleveland Cavaliers (2020 – dosud)
23. listopadu 2020 byl McGee vyměněn z Los Angeles Lakers do Clevelandu Cavaliers výměnou za Alfonza McKinnieho a Jordan Bell.