19. helmikuuta 1942, Pres. Franklin D.Roosevelt allekirjoitti toimeenpanomääräyksen 9066, jossa sotasihteeri Henry Lewis Stimsonille ja hänen komentajilleen annettiin valta ”määrätä sotilasalueita sellaisissa paikoissa ja siinä määrin kuin hän tai asianomainen sotilaskomentaja voi päättää, mistä kuka tai kaikki henkilöt voivat olla poissuljettuja. ” Määräyksessä ei nimetty mitään erityistä ryhmää tai sijaintia, mutta melkein kaikki länsirannikon japanilaiset amerikkalaiset joutuivat pian karkottamaan itsensä ja perheensä siirtolaisiksi internointileireille. Kolmen vuoden ajan japanilaiset amerikkalaiset joutuivat elämään harvoissa olosuhteissa, piikkilanka jatkuvassa epäilysten ja uhkien pilvessä. 75 vuotta myöhemmin japanilaisten amerikkalaisten pakotettu internointi toisen maailmansodan aikana on laajalti tuomittu rasistiseksi ja muukalaisvihaiseksi ja kansallisen häpeän ajanjaksoksi.
Määräys annettiin kaksi kuukautta Japanin armeijan hyökkäyksen jälkeen Pearl Harbouriin, mutta sen kohdistaminen japanilaisiin amerikkalaisiin ja siitä johtuvaan vankeuteen juonsi juurensa myös rasistisen ja aasialaisten maahanmuuttajien liittovaltion pitkään historiaan. 1800-luvun lopun rajoittavaan maahanmuuttopolitiikkaan huolimatta siitä, ettei ole todisteita siitä, että epäillään, että japanilaiset amerikkalaiset olisivat merkittävä uhka sabotoijina ja Kansalaisvapauksien loukkaamisen takia ajatus pyörittää japanilaiset amerikkalaiset länsirannikolle ja siirtää heidät maan sisäosien pidätyskeskuksiin kansallisen turvallisuuden nimissä (John J.McCloy, sodan apulaissihteeri) , sanoi tunnetusti, että jos valinta oli kansallisen turvallisuuden ja Yhdysvaltain perustuslain mukaisten kansalaisvapauksien välillä, perustuslaki ”oli vain paperinpalaa”).
Lyhyen yön ulkonaliikkumiskiellon jälkeen 31. maaliskuuta 1942 japanilaisille amerikkalaisille, jotka asuivat länsirannikolla, käskettiin rekisteröidä itsensä ja perheenjäsenensä ja heidän oli pakko jättää kaikki, mitä he eivät voineet kantaa taakseen; monilla ei ollut muuta vaihtoehtoa kuin myydä omaisuutensa ja yrityksensä murto-osalla arvostaan, usein omille naapureilleen ja entisille ystävilleen. Vuosina 1942–1945 noin 120000 japanilaista kulttuuriperintöä omistavaa Yhdysvaltain kansalaista vangittiin yhdestä kymmenestä leiristä, jotka sijaitsevat Kaliforniassa, Arizonassa, Wyomingissa, Coloradossa, Utahissa ja Arkansasissa. Elinolosuhteet olivat paljaat luut, eristämättömissä kasarmeissa, joita lämmitettiin kivihiiltä polttavilla uuneilla, tavallisilla käymälöillä, vähän kuumalla juoksevalla vedellä ja annoksilla. Vaikka japanilaiset amerikkalaiset yrittivät luoda ulkonäön yhteisöstä perustamalla kouluja, urheilua ja muuta toimintaa, he tekivät niin asevoimien jatkuvan valvonnan alaisena käskemällä ampumaan kaikki, jotka yrittivät lähteä.
Vankila aiheutti useita mielenosoituksia ja laillisia taisteluita, erityisesti Korematsu v. Yhdysvallat, joka määräsi 6–3 tukemaan Fred Korematsun tuomiota kieltäytymisestä alistumasta käskyyn. Yhdysvaltain asianajaja vahvisti kuitenkin vuonna 2011, että edeltäjä, joka oli väittänyt hallituksen puolesta tässä asiassa, oli valehdellut tuomioistuimelle pidättämällä Yhdysvaltain merivoimien tiedusteluraportin, jossa todettiin, että japanilaiset amerikkalaiset eivät aiheuttaneet uhkaa Yhdysvalloille tuolloin . Viimeinen leiri lopulta suljettiin vuonna 1946, mutta vasta 1976. Gerald Ford kumosi virallisesti toimeenpanomääräyksen 9066 ja totesi: ”Tiedämme nyt, mitä meidän olisi pitänyt tietää silloin – paitsi se, että evakuointi oli väärin, myös japanilaiset amerikkalaiset olivat ja ovat uskollisia amerikkalaisia…. Kehotan amerikkalaisia vahvistamaan kanssani tämän amerikkalaisen Lupa – että olemme oppineet tuon kauan sitten kokemuksen tragediasta arvostamaan vapautta ja oikeudenmukaisuutta jokaiselle yksittäiselle amerikkalaiselle ja päättämään, että tällaista toimintaa ei enää koskaan toisteta. ”
Vuonna 1988 Kongressi pyysi virallisesti anteeksi japanilaisia amerikkalaisia, ja kansalaisvapauksien lailla myönnettiin 20 000 dollaria kullekin noin 80 000 eloon jääneelle internoidulle ja heidän perheelleen. Vaikka presidentin toimikunnat ovat pitäneet tilausta rodullisina ennakkoluuloja, sotahysteriaa ja poliittisen johtajuuden epäonnistumisena, jopa 75 vuotta myöhemmin 9066: n perintö perii edelleen, kun jotkut tutkijat ja poliitikot yrittävät edelleen perustella japanilaisten amerikkalaisten vangitsemista käyttämällä tätä häpeällistä Amerikan aikaa historia suunnitelmana muille maahanmuuttajille ja Yhdysvaltojen kansalaisille suunnatulle muukalaisvihamieliselle politiikalle.