Morales haastattelee Jill Bideniä Valkoisessa talossa vuonna 2016.
Yliopiston jälkeen Morales työskenteli Chase Bankissa ennen journalistiuraa. Hän aloitti uransa News 12 – Bronxissa ensimmäisenä aamuankkurina News 12: ssä – The Bronxin ensimmäinen uutisjohtaja Roberto Soto ja alkuperäiset studio-johtajat Tom D’Elia, Brian Webb, Darryl Stith ja David Rein . Hän toimi myös kameranoperaattorina, toimittajana ja tuottajana verkostossa.
Morales jatkoi viikonloppuankkurina / -toimittajana ja aamu-ankkurina WVIT-TV: ssä Hartfordissa, Connecticutissa, missä hän raportoi Columbinen ampumista, hirmumyrsky Floydista, vuoden 2000 presidentinvaaleista ja 11. syyskuuta 2001. Hän isännöi ja raportoi myös Emmy-ehdokkaalle dokumentille Save Our Sound, WNBC: n kanssa yhteiselle tuotannolle Long Islandin säilyttämisestä. Ääni. Vuonna 1999 hänet äänestettiin 50 vaikutusvaltaisimman Latinalaisen joukkoon uutislähetystensä ja espanjalaisen El Diario La Prensa -lehden raporttien perusteella. Aiemmin Morales vietti kaksi vuotta työskentelemällä kulissien takana Court TV: ssä.
Morales oli MSNBC: n ankkuri ja kirjeenvaihtaja vuosina 2002-2002 6. Hän kertoi siellä useista tärkeistä uutisista, mukaan lukien vuoden 2004 presidentinvaalit, vuoden 2004 kesäolympialaiset Ateenassa, Kreikassa, Irakin vankien väärinkäyttö, Irakin vapauden operaatio, Kolumbian avaruusaluksen katastrofi, Koillisen pimennys vuonna 2003, 2002 Beltway ampujaiskut ja Scott Petersonin tutkinta ja oikeudenkäynti. Lisäksi hänet nimitettiin yhdeksi Latinalaisen Amerikan aikakauslehden vuoden 2003 parhaista trenditekijöistä.
Morales liittyi Today-näyttelyyn vuonna 2006 kansallisena kirjeenvaihtajana, ja hänet nimitettiin näyttelyn kolmanneksi tunniksi maaliskuussa 2008. 9. toukokuuta 2011 ilmoitettiin, että Morales korvaa Ann Curryn Today-uutisankkurina, kun Curry seurasi Meredith Vieiraa tämän päivän isäntänä kesäkuussa 2011. Vuonna 2016 ilmoitettiin, että Morales siirtyy länteen isännöimään Accessia ja tullut Today Show West Anchor. Vuonna 2019 Morales poistui Accessin isännöinnistä ja pysyi Today Show West Coast -ankkurina.