William Shea odegrał kluczową rolę w przywróceniu National League baseballu do Nowego Jorku po pięciu latach nieobecności.
Po sezonie 1957 Brooklyn Dodgers i New York Giants przeniosły się z Nowego Jorku York do Kalifornii, aby stać się Los Angeles Dodgers i San Francisco Giants, pozostawiając największe miasto w Stanach Zjednoczonych bez franczyzy National League i tylko jedną główną drużynę ligową, New York Yankees of the American League (AL). Wraz z groźbą dołączenia drużyny z Nowego Jorku do nowej trzeciej ligi, Liga Narodowa rozszerzyła się o New York Mets na wniosek Williama Shea. W symbolicznym nawiązaniu do wcześniejszych drużyn National League w Nowym Jorku, nowy zespół przyjął jako podstawowe kolory niebieski Dodgers i pomarańczowy Giants, które to kolory znajdują się również na fladze Nowego Jorku. Przyjęto przydomek „Mets”: był to naturalny skrót od korporacyjnej nazwy klubu, „The New York Metropolitan Baseball Club, Inc.”, nawiązuje do „Metropolitans” (nowojorskiej drużyny z American Association z 1880 do 1887), a jego zwięzłość była korzystna dla nagłówków gazet.
Shea Stadium był domem Metsów boiska od 1964 do 2008 roku.
Przez pierwsze dwa lata swojego istnienia drużyna grała u siebie na historycznym boisku Polo na Górnym Manhattanie. W 1964 roku przeniosła się na nowo wybudowany Shea Stadium w Flushing w Queens, gdzie Mets grali do sezonu 2008. W 2009 roku klub przeniósł się na Citi Field, sąsiadujące z dawnym stadionem Shea.
W swojej historii Mets zdobyli dwa tytuły World Series (1969 i 1986), pięć proporczyków National League (1969, 1973, 1986, 2000, 2015) i sześć tytułów National League East (1969, 1973, 1986, 1988) , 2006, 2015). The Mets zakwalifikowali się również do sezonu posezonowego jako drużyna z dziką kartą National League w 1999, 2000 i 2016 r. Mets wystąpili w pięciu World Series, więcej niż jakikolwiek inny zespół ekspansyjny w historii MLB. Ich dwa mistrzostwa mają taką samą liczbę tytułów wśród drużyn z ekspansji, co równa się wynikom Toronto Blue Jays, Miami Marlins i Kansas City Royals.
The Mets utrzymali rekord frekwencji w nowojorskim baseballu w jednym sezonie od 29 lat. Pobili rekord Yankees z 1948 roku, przyciągając prawie 2,7 miliona widzów w 1970 roku. The Mets pobili swój własny rekord pięć razy, zanim ten rekord został odzyskany przez Yankees w 1999 roku.
Tom Seaver poprowadził Metsów do zwycięstwa w World Series 1969.
Mets 1962 opublikował 40-120 rekord, rekord największej liczby porażek w sezonie od 1899. W 1966 roku Mets ominęli przyszły Hall of Famer Reggie Jackson w amatorskim drafcie, zamiast tego wybrali Steve’a Chilcotta, który nigdy nie grał w głównych turniejach. Ale w następnym roku oni zdobył przyszłą galerię sław Toma Seavera w loterii. Seaver pomógł drużynie „Miracle Mets” w 1969 roku zdobyć nowy tytuł National League East Division, a następnie pokonać Atlanta Braves, aby wygrać proporzec National League i bardzo faworyzowany Baltimore Orioles, aby wygrać World 1969 Seria.
W 1973 roku Mets awansowali z 5. miejsca, aby wygrać dywizję, pomimo rekordu tylko 82-79. Zszokowali mocno faworyzował Cincinnati Reds „Big Red Machine” w NLCS i spowodował, że obrońca mistrzów World Series, Oakland Athletics, przeszedł do siódmego meczu, ale przegrał serię. Warto zauważyć, że 1973 był jedynym tytułem NL East między 1970 a 1980 rokiem, którego nie zdobyli ani Philadelphia Phillies, ani Piraci z Pittsburgha.
Tom Seaver został sprzedany w 1977 roku, w dniu zapamiętanym jako „ The Midnight Massacre „, a Mets spadli na ostatnie miejsce przez kilka lat. Franczyza zmieniła się w połowie lat 80. W tym czasie Mets stworzyli także Sluggera Darryl Strawberry (# 1 w 1980) i zdobywcę Cy Young Award z 1985 r., Dwight Gooden (# 5 w 1982 r.). Ponadto były MVP National League i wieloletni zdobywca Złotej Rękawicy Keith Hernandez został pozyskany przez Mets w 1983 r.
W 1985 roku pozyskali łapacza Hall of Fame Gary’ego Cartera z Montrealu Expos i wygrali 98 meczów, ale niewiele brakowało do playoffów. W 1986 roku wygrali dywizję z rekordem 108-54, jednym z najlepszych w historii National League. Wygrali dramatyczną NLCS w sześciu meczach z Houston Astros. szósta gra z tej serii trwała szesnaście rund, najdłuższa gra play-off w historii do 2005 roku. Byli w jednym uderzeniu po przegranej World Series z Boston Red Sox, zanim seria trafień i błędów defensywnych ostatecznie doprowadziła do błędu Billa Bucknera z Bostonu, który dał Metsowi zwycięstwo w meczu szóstym. Następnie wygrali mecz 7, aby wygrać drugi tytuł World Series.
Mike Piazza grał w Mets w 2004 roku .
The Mets kontynuowali dobrą grę po 1986 roku i wygrali dywizję w 1988 roku, ale przegrali w NLCS tego roku i spadli do lat 90. Byli poza rywalizacją aż do sezonu 1997, kiedy rywalizowali z dziką kartą aż do ostatniego tygodnia sezonu. W 1998 roku Mets zdobyli łapacza Mike’a Piazza w przebojowej transakcji i przegapili sezon posezonowy tylko jednym meczem. W 1999 roku doszli do play-offów po jednym meczu play-off, ale przegrali 1999 National League Championship Series z Atlanta Braves. W 2000 roku z łatwością wywalczyli dziką kartę w play-offach i wywalczyli wyjazd na World Series 2000 przeciwko swoim rywalom z New York Yankees za „Subway Series”. The Mets zostali pokonani przez Yankees w pięciu meczach.
Mets prawie nie trafili w playoff w 2001 roku i walczyli w latach 2002-2004. Po sezonie 2004 Mets zatrudnił nowego dyrektora generalnego, Omar Minaya, który natychmiast zmienił franczyzę, podpisując kontrakt z dzbanem Pedro Martínezem i zatrudniając nowego menedżera, Williego Randolpha. The Mets zakończyli w 2005 roku cztery mecze powyżej 0,500, a odrodzenie franczyzy zakończyło się do 2006 roku, kiedy wygrali 97 meczów i tytuł NL East za nowymi nabytkami Carlosa Beltrána i Carlosa Delgado, a także młodych gwiazd José Reyes i Davida Wrighta. Mets awansowali do siódmego meczu NLCS z 2006 roku, ale przegrali po zwycięskim dwumeczu u siebie Yadiera Moliny na szczycie dziewiątej rundy. Mets załadowali bazy dwoma outami w dolnej części rundy, ale Adam Wainwright uderzył Beltrana z druzgocącą krzywą.
W 2007 roku Mets weszli do ostatnich 17 meczów w sezonie z siedmioma – prowadzenie gry w dywizji. Jednak zespół przeszedł przez niefortunną passę przegranych, przegrywając 11 z następnych 15 meczów i zmuszając do wygrania dwóch ostatnich spotkań, aby przejść do playoffów. The Mets wygrali przedostatni mecz, ale w ostatnim dniu sezonu Tom Glavine w pierwszej rundzie rzucił siedem przejazdów, przegrywając 8: 1, co wyeliminowało drużynę z rywalizacji. Philadelphia Phillies wygrała dywizję jednym meczem po zwycięstwie ostatniego dnia sezonu.
David Wright był ostatnim kapitanem Mets przed przejściem na emeryturę w 2018 roku.
Mets prowadzili skromniejsze 3,5-meczowe prowadzenie po 145 meczach sezonu 2008, ich ostatnim sezonie w Shea Stadion. Chociaż ich ocena 7–10 na tym odcinku była lepsza niż 5–12 z poprzedniego sezonu, to i tak pozwoliło Philliesom ponownie wyprzedzić ich o koronę dywizji, którą przegrali trzema meczami. The Mets otworzyli Citi Field w 2009 roku, ale nie byli czynnikiem ze względu na wysypkę kontuzji wielu kluczowych graczy, w tym Reyesa, Carlosa Beltrána, Carlosa Delgado, Ólivera Péreza i Livána Hernándeza. Skutki obrażeń spadły w Mets do rekordu 70-92. The Mets poprawili się do 79-83 w 2010 roku, ale nadal zajęli czwarte miejsce, nie mogąc w playoffach po raz czwarty z rzędu.
Po sezonie 2010 Mets zwolnił Minayę i menedżera Jerry’ego Manuela. Były Oakland Athletics G.M. i dyrektor MLB Sandy Alderson został zatrudniony do kierowania zespołem, który zatrudnił Terry’ego Collinsa jako menedżera.
W 2012 roku właściciele Mets, Fred Wilpon i Saul Katz, rozstrzygnęli pozew wytoczony im w imieniu ofiar Bernarda Madoffa „programu Ponziego na 162 miliony dolarów. W wyniku tej umowy likwidator, Irving Picard, zgodził się zrezygnować z oskarżeń, które Wilpon i Katz na ślepo zgodzili się z tym planem na ich własną korzyść. Picard pierwotnie starał się odzyskać 1 miliard dolarów od Rodzina Wilpon i Katz, ale rozliczyli się na 162 miliony dolarów wraz z przyznaniem, że ani Wilpons, ani Katz nie mieli żadnej wiedzy o programie Ponzi. W latach 2011–2012 Mets sprzedał dwanaście mniejszościowych udziałów 4% (48%) franczyzy za 20 dolarów miliona za sztukę, aby zapewnić drużynie zastrzyk gotówki w wysokości 240 milionów dolarów.
Pomimo kolejnego przegranego sezonu, Mets przeszedł do historii w 2011 roku, kiedy bliżej Jason Isringhausen zrealizował 300 rzut obronny z drużyną, trzeci gracz franczyzy historia do osiągnięcia kamień milowy w organizacji (po Johnie Franco i Billy Wagnerze). Ponadto, Reyes został pierwszym Met w historii franczyzy, który zdobył tytuł mistrza National League, notując średnią 0,337. W 2012 roku, gdy Mets próbowali odbić się od trzech kolejnych przegranych sezonów, stracili gwiazdę shortstop Reyesa na rzecz wolnej agencji, kiedy podpisał kontrakt z Miami Marlins. Zespół zaczynał dobrze, osiągając w karierze występ jedynego bramkarza w lidze, RA Dickey, i mocną produkcję z Wright. Ale zawahali się w połowie sezonu i zakończyli rekordem 74-88, ponownie zajmując czwarte miejsce w lidze.
Johan Santana rzucił jedynego w historii Metsa, który nie miał trafienia.
Przed sezonem 2012 Mets jeszcze nie rzucili niczyjego, a gracze serii przeszli 8019 meczów bez rzucenia jednego – dłużej niż jakikolwiek inny duży -ligi. Byli jedną z zaledwie dwóch drużyn w lidze, która nigdy nie miała żadnego miotacza, który nie trafił (drugim był San Diego Padres). Jednak 1 czerwca 2012 roku Johan Santana rzucił bez trafienia przeciwko St. Louis Cardinals Odwracając uwagę od powrotu Carlosa Beltrána na Citi Field, Santana zmieniła rutynową grę w niezapomniany moment w historii Mets. Santana ryzykował usunięciem z gry po przekroczeniu limitu 110 wyciągów ustawionych przez drużynę z powodu operacji barku. Mimo to Santana pozostał w grze i rzucił tego wieczoru 134 narzuty, wygrywając 8-0 Mets, z pomocą kilku świetnych zagrań defensywnych, a także kontrowersyjnego wezwania do faulu (przypadkowo na Beltranie). hitter w historii Mets. To był szczyt 2012 roku wraz z miotaczem R.A. Dickey zdobywając nagrodę National League Cy Young Award. To był jednak ostatni sezon Dickeya z Metsem, ponieważ wraz z Joshem Thole’em i Mike’em Nickeasem zostali sprzedani do Toronto Blue Jays za potencjalnych klientów Travisa d „Arnauda, Noah Syndergaarda, Wuilmera Becerrę i weterana łapacza Johna Buck’a. Sezon 2013 przyniósł kolejne 74-88 finiszów, ale udało im się zająć 3. miejsce. Punktem kulminacyjnym sezonu było rozegranie serii sezonów między ich rywalami Yankees z miedzy miastami, pierwszym od czasu rozpoczęcia rozgrywek między ligami w 1997 roku.
Jacob deGrom, debiutant roku 2014 oraz zdobywca nagrody Cy Young w 2018 i 2019 roku.
Przed rozpoczęciem sezonu 2014 Mets zdobyli duży plusk na rynku wolnych agentów, podpisując 4-letni kontrakt na 60 milionów dolarów, byłego zawodnika New York Yankees, Curtisa Grandersona. Podpisali również byłego miotacza Oakland Athletics, Bartolo Colóna, z dwuletnią umową, która ma pomóc zrównoważyć przegranego miotacza asa Matta Harveya za rok po operacji Tommy’ego Johna. Poprawiliby się do 79-83 i zakończyli sezon zremisowanym na 2. miejscu z Atlantą, ale to był ich szósty sezon z rzędu, w którym zakończyli sezon poniżej 0,500. Pitcher Jacob deGrom wygrałby debiutanta roku National League.
23 kwietnia 2015 roku Mets wyrównał rekord sezonu serii jedenastu zwycięstw z rzędu. Po raz pierwszy w swojej historii Mets wygrał dziesięć meczów z własnym gospodarzem, stając się siódmą drużyną od 1900 roku, który wygrał co najmniej 10 meczów z własnej drużyny. 26 września 2015 r. Mets zdobyli tytuł NL East Division, a tym samym ich pierwsze miejsce po sezonie od 2006 roku, pokonując Cincinnati Reds 10-2. Pokonali Los Angeles Dodgers w NLDS, trzy mecze do dwóch, i zgarnęli Chicago Cubs w NLCS po ich pierwszy od 15 lat proporzec. W World Series 2015 zostali pokonani przez Kansas City Royals w pięciu meczach. Po zakończeniu sezonu miotacz Matt Harvey zdobył nagrodę NL Comeback Player of the Year. Zapolowy Yoenis Céspedes zdobył nagrodę NL Gold Glove jako lewy obrońca.
The Mets powrócili do sezonu posezonowego w 2016 roku, oznaczając dopiero drugi raz w historii franczyzy, w którym drużyna zakwalifikowała się do sezonu posezonowego w kolejnych latach. Z rekordem 87-75 zespół zakwalifikował się do gry z dziką kartą, ale przegrał tylko 3-0 z San Francisco Giants. W tym samym roku Céspedes został uhonorowany nagrodą Silver Slugger, a zapolowy Curtis Granderson został uhonorowany nagrodą Roberto Clemente. Metsowi nie udało się przejść do playoffów przez resztę dekady, kończąc nie wyżej niż trzecie miejsce w 2019, kiedy zakończyli zwycięskim rekordem 86-76 (najwyższy ze wszystkich drużyn, które nie zakwalifikowały się do sezonu posezonowego). Koniec dekady zbiegł się z tym, że Jacob deGrom otrzymał dwie kolejne nagrody Cy Young Awards (w tym za sezon 2018, w którym miotacz zakończył rok z 1.70 ERA) i pierwszym basem, Pete Alonso, zdobywając tytuł Rookie of the Year 2019 i kończąc sezon z 53 prowadzącymi w pierwszej lidze rozgrywkami u siebie – najwięcej spośród debiutantów w historii MLB.
W dniu 28 sierpnia 2020 roku Amed Rosario pokonał Yankees na Yankee. Stadion. Metsowie zostali wyznaczeni jako gospodarze, ponieważ odrabiali wcześniej odwołany mecz. To był pierwszy raz, kiedy zawodnik uderzył w piłkę domową na boisku przeciwnika od czasu, gdy Ed McKean uderzył go w St. Louis Perfectos przeciwko Cleveland Spiders w 1899 roku.
30 października W 2020 roku Steve Cohen stał się większościowym właścicielem Mets, posiadając 95% zespołu, co czyni go obecnym najbogatszym właścicielem w baseballu. Kupił drużynę od rodziny Wilpon za 2,475 miliarda dolarów, a Wilpons zachował pozostałe 5%.