Kollisionen mit Kometen und Asteroiden
1994 stürzte der im Vorjahr entdeckte Comet Shoemaker-Levy 9 in Jupiters Atmosphäre nach dem Aufbrechen in mehr als 20 Fragmente. Die aufeinanderfolgenden Explosionen wurden von Teleskopen auf der Erdoberfläche, dem erdumlaufenden Hubble-Weltraumteleskop und dem Galileo-Raumschiff auf dem Weg zum Jupiter beobachtet. Nur Galileo sah die Explosionen direkt, weil sie von der Erde aus gesehen auf der Rückseite des Jupiter auftraten. Trotzdem stiegen die Feuerbälle, die von den größten Fragmenten erzeugt wurden, über das Glied des Planeten und die resultierenden schwarzen Flecken in Jupiters Wolkenschichten waren sogar in kleinen Teleskopen sichtbar, als Jupiters Rotation sie in Sicht brachte. Spektroskopische Untersuchungen ergaben, dass die Auswirkungen viele Chemikalien wie Wasser, Cyanwasserstoff und Kohlenmonoxid erzeugt oder abgegeben hatten, Substanzen, die auf Jupiter existieren, jedoch in viel geringeren Konzentrationen. Das überschüssige Kohlenmonoxid und der Cyanwasserstoff blieben einige Jahre nach dem Ereignis in der oberen Atmosphäre nachweisbar. Zusätzlich zu seinem eigentlichen Interesse stimulierte die Kollision eines Kometen mit Jupiter detaillierte Studien über die Auswirkungen, die Kometeneinschläge auf die Erde haben würden (siehe Gefahr von Erdaufprallen).
Im Jahr 2009 erschien in der Nähe des Südpols des Jupiter ein dunkler Fleck ähnlich dem, den die Fragmente des Kometen Schuhmacher-Abgabe 9 hinterlassen hatten. Da nur ein Fleck gesehen wurde, wurde angenommen, dass Der aufprallende Körper war eher ein einzelner Körper – entweder ein Komet oder ein Asteroid – als eine Kette von Fragmenten.