Nejistá situace španělských Habsburků, kteří kvůli nedostatku mužských dědiců byli na pokraji vyhynutí, se projevila pověstmi, které syn označil tak katastrofálně důsledky masivní příbuzenské plemenitby byla ve skutečnosti dcera, která byla světu představena jako chlapec z paniky, že dynastie byla u konce.
Princ byl smutnou podívanou a jeho chabé zdraví způsobil, že se rodina bála o jeho život. Charles byl postižen téměř bizarní ošklivostí; v něm byla klasická habsburská fyziognomie – prognatická čelist a protáhlá lebka – přehnaná do téměř karikaturní míry.
V pověrčivých přesvědčeních té doby někteří jeho žalostný stav a fyzickou deformaci interpretovali jako důkaz okouzlení. Neúspěšné pokusy o vyléčení jeho lékaři byly doprovázeny okultními praktikami a exorcismy prováděnými kněžími.
S ohledem na jeho slabost (trpěl vrozenou srdeční vadou) byl princ zacházen s extrémní péčí jako dítě. Naučil se číst a psát až ve relativně pozdním věku a byl vyloučen z jakéhokoli vyššího vzdělání, takže jako dospělý byl držen stranou od vládních záležitostí. Jeho chování bylo poznamenáno imbecilitou a infantilismem; například miloval počítání věcí, což je činnost, z níž čerpal velké potěšení a ujištění.
Charlesův skutečný stav je z dnešní perspektivy obtížné posoudit. Potřeboval by pečlivé a svědomité vedení, něco, co lidé kolem něj nedokázali poskytnout, protože různá uskupení u soudu měla velký zájem o slabého krále. Celý život byl Charles pod měnícím se vlivem soupeřících frakcí, které však byly sjednoceny ve snaze instrumentovat krále pro své vlastní účely.
A Charles byl skutečně snadno ovlivnitelný: vždy následoval návrhy lidí kolem sebe, na nichž byl zcela závislý. Nejprve měl na mentálně křehkého panovníka největší vliv jeho matka a její poradce, rakouský jezuita a zpovědník Johann Eberhard Nithard a později první ministr Fernando Valenzuela. Charlesova nevlastní bratr Don Juan José, produkt mimomanželského kontaktu mezi jeho otcem a herečkou Marií Calderón, se pro něj později stal důležitou osobností. Juan José však krále zneužil také jako nástroj svých ambicí.
Podle poslední vůle jeho otce Filipa IV. Měl být prohlášen za Charlese, který dosáhl většiny po dosažení čtrnácti let a převzal regentství. Charlesova matka, vdova, královna Maria Anna, tomu chtěla zabránit a tvrdila, že její syn ještě nebyl dostatečně psychicky ani fyzicky zralý na tuto velkou odpovědnost. Pod vlivem opozice však Charles odmítl podepsat svůj podpis dohody, která odkládá prohlášení jeho většiny o dva roky. Teprve po násilném přesvědčování jeho matky byl přinucen jej podepsat.
Poté, co v roce 1675 nakonec dosáhl své většiny, se dostal pod vliv svého nevlastního bratra Juana Josého, který po svém návratu do exilový soud zbavil stranu královny vdovy moci a převzal vládu silou zbraní.
Don Juan José spravoval záležitosti vlády jménem Charlese až do své smrti v roce 1679. Podporoval rozvoj jeho slabého bratra a zdálo se, že došlo k nějakému zlepšení. V rámci své politiky sblížení s Francií vyjednal s Charlesem sňatek s francouzskou princeznou Marií Louise z Orléans.
Po náhlé smrti Dona Juana Josého se Charles znovu dostal pod vliv své matky. Charlesova druhá manželka Maria Anna z Falcka-Neuburgu také ovlivnila krále v její prospěch a byl degradován na pouhou figurku v boji o moc mezi svou matkou a manželkou.