Az 1880-as években Párizsban a Palais Garnier Operaházat vélhetően az Opera fantomjának vagy egyszerűen az Operaszellemnek nevezett entitás kísért. Joseph Buquet nevű színpadi kezét akasztva találják, hiányzik a nyakán lévő hurok.
Az operaház visszavonulásának ünnepi előadásán egy fiatal, kevéssé ismert svéd szopránt, Christine Daaé-t hívják énekelni az Opera vezető szopránja helyett, Carlotta, aki beteg, és Christine teljesítménye elképesztő siker. Raoul de Chagny vicomte, aki jelen volt az előadáson, gyermekkori játszótársának ismeri el, és felidézi iránta érzett szeretetét. Megpróbálja ellátogatni a kulisszák mögé, ahol hallja, ahogy egy férfi bókol az öltözője belsejéből. Miután Christine elmegy, a szobát vizsgálja, csak üresnek találja.
Perros-Guirecnél Christine találkozik Raoul-val, aki szembeszáll a szobájában hallott hanggal. Christine elmondja neki, hogy a Zene Angyala oktatta, akiről apja szokta mesélni. Amikor Raoul azt sugallja, hogy tréfa áldozata lehet, elviharzik. Christine egy éjszaka meglátogatja apja sírját, ahol egy titokzatos alak jelenik meg, és hegedül neki. Raoul megpróbál szembeszállni vele, de közben megtámadják és kiütik.
Vissza a Palais Garnierhez, az új menedzserek levelet kapnak a Phantomtól, amelyben követelik, hogy engedjék meg Christine-nek, hogy töltse be Marguerite főszerepét a Faustban, és hagyja üresen az 5. mezőt a használatához, nehogy olyan házban lépjenek fel, ahol átok van rajta. követelései tréfa, és figyelmen kívül hagyja őket, ami katasztrofális következményekkel jár, mivel Carlotta végül gügyög, mint egy varangy, és a csillár hirtelen a nézők közé esik, megölve egy nézőt. A Fantom, miután Christine-t elrabolta öltözőjéből, felfedi magát, egy torz férfit, akit Eriknek hívnak.
Erik néhány napig a fogolyában akarja tartani az odújában. Ennek ellenére megváltoztatja a terveit, amikor leleplezi, és mindkettő rémületére meglátja orr nélküli, beesett szemű arcát, amely hasonlít évszázadok alatt kiszáradt koponya. Attól tartva, hogy elhagyja őt, úgy dönt, hogy tartósan megtartja, de amikor Christine két hét múlva felszabadulást kér, beleegyezik abba a feltételbe, hogy a nő viselje a gyűrűjét, és hű legyen hozzá.
A tetőn az Operaházban Christine elmondja elrablásáról Raoul-nak, és megígéri Raoul-nak, hogy elvisz egy olyan helyre, ahol Erik soha nem találja meg, még akkor sem, ha ellenáll. Raoul elmondja Christine-nek, hogy másnap megfogadja az ígéretét, amivel a lány beleegyezik. Christine azonban együtt érez Erikkel, és úgy dönt, hogy még egyszer utoljára énekel neki a búcsúzás eszközeként. Christine és Raoul tudta nélkül Erik figyelte őket, és hallotta az egész beszélgetésüket.
A következő este a felbőszült és féltékeny Erik elrabolja Christine-t a Faust produkciója során, és megpróbálja őt feleségül venni. Raoul-t egy titokzatos, csak “perzsa” néven ismert Operaház vezeti Erik titkos odújába az Operaház mélyén. Ennek ellenére Erik egy tükrös helyiségben csapdába esik, aki azzal fenyeget, hogy hacsak Christine nem járul hozzá feleségül veszi őket, és az Operaházban mindenkit meg fog ölni robbanóanyagok használatával.
Christine beleegyezik abba, hogy feleségül veszi Eriket. Erik eleinte megpróbálja elfojtani Raoul-t és a perzsait, azzal a vízzel, amelyet tönkrement volna a robbanóanyagok. Ennek ellenére Christine könyörög és felajánlja “élő menyasszonyának”, megígérve neki, hogy miután megölte a menyasszonyát, nem ölje meg magát, mivel éppen öngyilkosságot kísérelt meg. Erik végül kiszabadítja Raoul-t és a perzsa kínzókamráját.
Amikor Erik egyedül van Christine-nel, felemeli a maszkját, hogy megcsókolja a homlokát, és végül visszacsókolják. Erik elárulja, hogy soha nem csókolt senkit, beleértve a saját anyját sem, aki elmenekülne, ha valaha is megpróbálta megcsókolni.Ez érzelmek úrrá vannak rajta. Ő és Christine akkor együtt sírnak, és könnyeik “összekeverednek”. Ő is megfogja a kezét, és azt mondja: “Szegény, boldogtalan Erik”, ami “kutyává válik, aki meghalni kész érte”.
Megengedi a perzsának és Raoul menekülni, bár nem azelőtt, hogy megígérte volna Christine-nek, hogy halála napján meglátogatja és visszahozza az általa adott aranygyűrűt. Azt is megfogadja, hogy a perzsa azt ígéri, hogy utána elmegy az újságba, és beszámol a haláláról, mivel hamarosan “szeretetből” hal meg.
Valóban valamivel később Christine visszatér Erik odújába, kérésére eltemeti valahová, ahol soha nem találják, és visszahozza az aranygyűrűt. Utána egy helyi újság az egyszerű megjegyzést írja: “Erik meghalt.” Christine és Raoul együtt szöknek, soha nem térnek vissza.
Az epilógus darabokat alkot Erik életéből, olyan információkat, amelyeket az elbeszélő a perzsától kapott. Kiderül, hogy Erik egy építési vállalkozás tulajdonosának fia volt, születése során deformálódott.Szülőföldje, Normandia elől menekült el vásárokra és lakókocsikra dolgozni, Európában és Ázsiában a cirkusz művészetét oktatta, végül trükkpalotákat épített Perzsiában és Törökországban. Végül visszatért Franciaországba, és elindította saját építőipari vállalkozását. Miután alvállalkozásba adták a Palais Garnier alapítványainak a munkáját, Erik diszkréten odúkat épített magának, hogy eltűnhessen, rejtett részekkel és egyéb trükkökkel kiegészítve, amelyek lehetővé tették számára a vezetők kémkedését.