Het Amerikaanse consulaat opende voor het eerst in 1844 in de oude stad, binnen de Jaffapoort, in wat nu het Zweedse Christelijke Studiecentrum is. Aan het einde van de 19e eeuw verhuisde het consulaat naar een plek in de Straat van de Profeten. In 1912 verhuisde het naar Gershon Agron Street, in het huidige West-Jeruzalem. Het hoofdgebouw, een van de eerste huizen die buiten de oude stadsmuren werd gebouwd, werd in 1868 gebouwd door Ferdinand Vester, een Duitse lutherse missionaris. Een derde verhaal werd later toegevoegd. Op 23 mei 1948 werd de consul-generaal, Thomas C. Wasson, vermoord. In 1952 huurde het consulaat een ander gebouw aan Nablus Road, Oost-Jeruzalem.
Trump-administratie en fusie in US EmbassyEdit
Op 14 mei 2018 werd de nieuwe ambassade van de Verenigde Staten in Jeruzalem werd geopend op een klein deel van de Arnona-site van het consulaat-generaal van Jeruzalem en het is nu de nieuwe diplomatieke missie van de Verenigde Staten van Amerika naar de staat Israël, ter vervanging van de voormalige ambassade van de Verenigde Staten in Tel Aviv. Van de 1.000 medewerkers van de ambassade in Tel Aviv, zijn er ongeveer 50 overgeplaatst om de nieuwe ambassade te runnen.
Het consulaat-generaal zal blijven opereren als een onafhankelijke missie vanuit zijn historische Agron Road-site. De opening van de nieuwe ambassade viel samen met de bloedigste dag van de Gaza-grensprotesten in 2018, waarbij meer dan 40 Palestijnse demonstranten omkwamen. De opening valt ook samen met de 70e verjaardag van Israël als natie in deze moderne tijd.
Op 18 oktober 2018 kondigde de Amerikaanse minister van Buitenlandse Zaken Mike Pompeo aan dat de VS het Amerikaanse consulaat-generaal zou fuseren. met de onlangs verplaatste Amerikaanse ambassade in Jeruzalem tot één enkele missie. Pompeo kondigde ook aan dat de VS haar rapportage, outreach en programma in de Palestijnse Gebieden zouden voortzetten via een nieuwe eenheid voor Palestijnse Zaken binnen de Amerikaanse ambassade in Jeruzalem. Deze eenheid zal opereren vanuit de Agron Road-site in Jeruzalem. Hoewel de aankondiging werd verwelkomd door de Israëlische regering, beschuldigden Palestijnse functionarissen de regering-Trump voor het steunen van de claim van Israël op Jeruzalem.
Op 19 februari 2019 werd gemeld dat het Amerikaanse consulaat-generaal zou opgaan in de Amerikaanse ambassade in maart 2019. Op 4 maart 2019 stopte het consulaat-generaal met zijn activiteiten en werd het samengevoegd met de Amerikaanse ambassade, waarmee een einde kwam aan de Amerikaanse praktijk van het hebben van afzonderlijke diplomatieke missies naar de Israëli’s en Palestijnen. Het voormalige Agron Road-gebouw van het consulaat-generaal wordt omgedoopt tot de eenheid Palestijnse Zaken, die veel van de functies van het voormalige consulaat-generaal zal vervullen. De laatste consul-generaal was Karen Sasahara.
Als reactie op de fusie van het consulaat-generaal in de De Amerikaanse ambassade, Saeb Erekat, de secretaris-generaal van het Uitvoerend Comité van de PLO, drong er bij de internationale gemeenschap op aan de nieuwe eenheid voor Palestijnse Zaken te boycotten. Ondertussen riep mede-uitvoerend lid van het Uitvoerend Comité Hanan Ashrawi de sluiting van het Consulaat op. e Algemeen “een aanval op de Palestijnse rechten en identiteit.”