Morales interviewt Jill Biden in het Witte Huis in 2016.
Na haar studie werkte Morales bij Chase Bank voordat ze haar journalistieke carrière voortzette. Ze begon haar on-air-carrière bij News 12 – The Bronx als het eerste ochtendanker onder News 12 – The Bronx ’s eerste nieuwsregisseur Roberto Soto, en de originele studio-regisseurs Tom D’Elia, Brian Webb, Darryl Stith en David Rein . Ze diende ook als cameraman, redacteur en producent voor dat netwerk.
Morales ging verder als weekend-anker / verslaggever en ochtendco-anker bij WVIT-TV in Hartford, Connecticut, waar ze rapporteerde over de schietpartijen in Columbine, de orkaan Floyd, de presidentsverkiezingen van 2000 en de aanslagen van 11 september 2001. Ze was ook co-host en rapporteerde voor de voor een Emmy genomineerde documentaire Save Our Sound, een gezamenlijke productie met WNBC over het behoud van Long Island. Geluid. In 1999 werd ze uitgeroepen tot een van de 50 meest invloedrijke Latinas vanwege haar berichtgeving en rapporten van het Spaanse dagblad El Diario La Prensa. Eerder werkte Morales twee jaar achter de schermen bij Court TV.
Morales was een anker en correspondent voor MSNBC van 2002 tot 200 6. Ze vertelde daar over een aantal belangrijke nieuwsverhalen, waaronder de presidentsverkiezingen van 2004, de Olympische Zomerspelen van 2004 in Athene, Griekenland, de mishandeling van Irakese gevangenen, Operatie Iraqi Freedom, de ramp met Space Shuttle Columbia, de Northeast Blackout van 2003, de Beltway van 2002. sluipschutteraanvallen en het onderzoek en de berechting van Scott Peterson. Bovendien werd ze uitgeroepen tot een van Hispanic Magazine’s Top Trendsetters van 2003.
Morales trad in 2006 toe tot de Today-show als nationaal correspondent en werd benoemd tot co-anker van het derde uur van de show in maart 2008. Op 9 mei 2011 werd aangekondigd dat Morales Ann Curry zou vervangen als het nieuwsanker voor Today, toen Curry Meredith Vieira opvolgde als gastheer van Today in juni 2011. In 2016 werd aangekondigd dat Morales naar het westen zou verhuizen om Access en word de Today Show West Anchor. In 2019 stopte Morales met het hosten van Access en bleef hij aan als het anker van de Today Show West Coast.