În anii 1880, la Paris, se crede că Opera Palais Garnier este bântuită de o entitate cunoscută sub numele de Fantoma Operei, sau pur și simplu Opera Ghost. Un jucător de scenă numit Joseph Buquet este găsit spânzurat, lipsindu-i lațul de la gât.
La o reprezentație de gală pentru pensionarea celor doi manageri ai operei, o tânără, puțin cunoscută soprană suedeză, Christine Daaé, este chemată să cânte în locul sopranei principale a Operei, Carlotta, care este bolnavă, și performanța lui Christine au un succes uimitor. Vicomteul Raoul de Chagny, care a fost prezent la spectacol, o recunoaște drept colega de joacă din copilărie și își amintește dragostea pentru ea. Încearcă să o viziteze în culise, unde aude un bărbat care o complimentează din vestiarul ei. El investighează camera odată ce Christine pleacă, doar pentru a o găsi goală.
La Perros-Guirec, Christine se întâlnește cu Raoul, care o confruntă cu vocea pe care a auzit-o în camera ei. Christine îi spune că a fost îndrumată de Îngerul muzicii, despre care tatăl ei obișnuia să le spună. Când Raoul sugerează că ar putea fi victima unei farse, ea se năpustește. Christine vizitează mormântul tatălui ei într-o noapte, unde apare o figură misterioasă și cântă la vioară pentru ea. Raoul încearcă să o confrunte, dar este atacată și eliminată în acest proces.
Înapoi la Palais Garnier, noii manageri primesc o scrisoare de la Fantomă cerându-i să-i permită lui Christine să îndeplinească rolul principal al Margueritei în Faust și să lase caseta 5 goală pentru utilizarea sa, ca nu cumva să se desfășoare într-o casă cu un blestem pe ea. cererile sale sunt o farsă și le ignoră, rezultând consecințe dezastruoase, întrucât Carlotta sfârșește graind ca un broască, iar candelabrul cade brusc în audiență, ucigând un spectator. Fantoma, după ce a răpit-o pe Christine din vestiarul ei, se dezvăluie ca fiind un bărbat deformat numit Erik.
Erik intenționează să o țină prizonieră în bârlogul său cu el câteva zile. Totuși, ea îl determină să-și schimbe planurile când îl demască și, spre groaza amândurora, priveste chipul lui fara nas, cu ochii scufundati, care seamana un craniu uscat de secole. Temându-se că ea îl va părăsi, el decide să o țină definitiv, dar când Christine cere eliberarea după două săptămâni, este de acord cu condiția ca ea să-și poarte inelul și să-i fie fidelă.
Pe acoperișul la Opera, Christine îi spune lui Raoul despre răpirea ei și îl face pe Raoul să promită că o va duce într-un loc în care Erik nu o va putea găsi niciodată, chiar dacă rezistă. Raoul îi spune lui Christine că va acționa conform promisiunii sale a doua zi, cu care ea este de acord. Cu toate acestea, Christine simpatizează cu Erik și decide să cânte pentru el ultima oară ca mijloc de a-și lua rămas bun. Fără să știe de Christine și Raoul, Erik i-a urmărit și le-a auzit întreaga conversație.
În noaptea următoare, Erik, înfuriat și gelos, o răpește pe Christine în timpul unei producții a lui Faust și încearcă să o forțeze să se căsătorească cu el. Raoul este condus de un misterios Opera obișnuit cunoscut doar sub numele de „Persanul” în vizuina secretă a lui Erik, adânc în interiorul Operei. Totuși, ei ajung prinși într-o cameră oglindită de Erik, care amenință că, cu excepția cazului în care Christine este de acord cu se căsătorește cu el, îi va ucide și pe toți cei din Opera folosind explozivi.
Christine este de acord să se căsătorească cu Erik. Erik încearcă inițial să-l înece pe Raoul și pe persan, folosind apa care ar fi fost folosită pentru a stinge. Cu toate acestea, Christine imploră și se oferă să fie „mireasa sa vie”, promițându-i să nu se sinucidă după ce i-a devenit mireasă, deoarece tocmai încercase să se sinucidă. Erik îi eliberează în cele din urmă pe Raoul și pe persan din camera sa de tortură.
Când Erik este singur cu Christine, își ridică masca pentru a o săruta pe frunte și, în cele din urmă, i se dă un sărut înapoi. Erik dezvăluie că nu a sărutat niciodată pe nimeni, inclusiv pe mama sa, care ar fugi dacă ar fi vreodată a încercat să o sărute. El este copleșit de emoție. El și Christine atunci plângeți împreună, iar lacrimile lor se „amestecă”. Ea îl ține și de mână și spune: „Bietul, nefericit Erik”, ceea ce îl reduce la „un câine gata să moară pentru ea”.
Permite persanului și Raoul să scape, deși nu înainte de a-i face lui Christine promisiunea că îl va vizita în ziua morții sale și va returna inelul de aur pe care i l-a dat. De asemenea, face promisiunea persană că, după aceea, va merge la ziar și va raporta moartea sa, deoarece va muri în curând „de dragoste”.
Într-adevăr, cândva mai târziu, Christine se întoarce în vizuina lui Erik, și, la cererea lui, îl îngropă într-un loc unde nu va fi găsit niciodată și îi returnează inelul de aur. După aceea, un ziar local publică nota simplă: „Erik este mort.” Christine și Raoul fug împreună, să nu se mai întoarcă niciodată.
Epilogul reunește bucăți din viața lui Erik, informații pe care „naratorul” le-a obținut de la persan. Se dezvăluie că Erik era fiul unui proprietar de afaceri în construcții, deformat la naștere.A fugit din Normandia natală pentru a lucra la târguri și caravane, învățându-se în artele circului din Europa și Asia și, în cele din urmă, construind palate de trucuri în Persia și Turcia. În cele din urmă, s-a întors în Franța și și-a început propria afacere de construcții. După ce a fost subcontractat pentru a lucra la fundațiile Palais Garnier, Erik și-a construit discret un bârlog pentru a dispărea, completat cu pasaje ascunse și alte trucuri care i-au permis să spioneze managerii.