ArticleThe promoottorialueen suuntauksen perustila ja kehitys

Eukaryoottisten promoottorialueiden transkriptio on usein erilaista in vivo, mutta ei tiedetä, ovatko syntyneet antisense-RNA: t RNA-polymeraasi II (Pol II) -transkription mekanistinen sivutuote tai biologisesti merkityksellinen. Tässä käytämme toiminnallista evoluutiomenetelmää, joka sisältää syntyvän transkriptiokartoituksen S. cerevisiae -kannoissa, jotka sisältävät vierasta hiiva-DNA: ta. Ulkomaisten ympäristöjen promoottorialueet menettävät suunnan, joka heillä on kotoperäisillä lajeillaan. On selvää, että vieraassa DNA: ssa syntyvät satunnaiset promoottorialueet tuottavat samanlaisen transkription molempiin suuntiin, mikä osoittaa, että divergenttinen transkriptio on mekanistinen piirre, joka ei tarkoita funktiota näille transkripteille. Evoluution aikana syntyvät onnekkaat promoottorialueet edistävät kaksisuuntaista transkriptiota, ja ajan mittaan ne puhdistetaan mutaation avulla tai säilytetään uuden toiminnallisuuden mahdollistamiseksi. Samoin ihmisen transkriptio on kaksisuuntainen uusilla kehittyneillä tehostajilla ja promoottorialueilla. Siten promoottorialueet ovat luonnostaan kaksisuuntaisia ja ne on muokattu evoluutiosta poikkeavaan transkriptioon kohti koodaavia vs. ei-koodaavia RNA: ita.