Eukaryote promoterregio’s worden in vivo vaak divergerend getranscribeerd, maar het is niet bekend of de resulterende antisense-RNA’s zijn een mechanistisch bijproduct van RNA-polymerase II (Pol II) transcriptie of biologisch zinvol. Hier gebruiken we een functionele evolutionaire benadering die het in kaart brengen van ontluikende transcripties omvat in S. cerevisiae-stammen die vreemd gist-DNA bevatten. Promoterregio’s in vreemde omgevingen verliezen de directionaliteit die ze hebben in hun inheemse soort. Opvallend is dat toevallige promotorregio’s die ontstaan in vreemd DNA een gelijke transcriptie produceren in beide richtingen, wat aangeeft dat divergente transcriptie een mechanistisch kenmerk is dat geen functie impliceert voor deze transcripten. Toevallige promotorregio’s die tijdens de evolutie ontstaan, bevorderen bidirectionele transcriptie en worden na verloop van tijd door mutatie gezuiverd of behouden om nieuwe functionaliteit mogelijk te maken. Evenzo is menselijke transcriptie meer bidirectioneel bij nieuw ontwikkelde enhancers en promotorregio’s. Promotorregio’s zijn dus intrinsiek bidirectioneel en worden gevormd door evolutie om transcriptie te vertekenen in de richting van coderende versus niet-coderende RNA’s.
Leave a Reply