Eukariotyczne regiony promotora są często transkrybowane w sposób rozbieżny in vivo, ale nie wiadomo, czy powstałe antysensowne RNA są mechanistyczny produkt uboczny transkrypcji polimerazy RNA II (Pol II) lub znaczący biologicznie. Tutaj stosujemy funkcjonalne podejście ewolucyjne, które obejmuje mapowanie powstających transkryptów w szczepach S. cerevisiae zawierających obce DNA drożdży. Regiony promotorowe w obcych środowiskach tracą kierunkowość, jaką mają w swoich rodzimych gatunkach. Co ciekawe, przypadkowe regiony promotorowe powstające w obcym DNA wytwarzają jednakową transkrypcję w obu kierunkach, co wskazuje, że rozbieżna transkrypcja jest cechą mechanistyczną, która nie implikuje funkcji tych transkryptów. Przypadkowe regiony promotora powstające podczas ewolucji promują dwukierunkową transkrypcję iz czasem są oczyszczane przez mutację lub zachowywane, aby umożliwić nową funkcjonalność. Podobnie ludzka transkrypcja jest bardziej dwukierunkowa w nowo powstałych wzmacniaczach i regionach promotorowych. Zatem regiony promotorowe są z natury dwukierunkowe i są kształtowane przez ewolucję w celu przesunięcia transkrypcji w kierunku kodowania w porównaniu z niekodującymi RNA.
Leave a Reply