Le foie semble être très attractif pour de nombreux parasites qui peuvent soit habiter l’organe, soit passer au cours de leur développement normal ou peut être transporté vers le foie et y être détruit. Les parasites du paludisme ont un stade de développement court dans les hépatocytes, mais ils n’endommagent pas l’organe. Pour les leishmanies (complexe de Leishmania donovani) les cellules de Kupffer sont les cellules cibles provoquant la leishmaniose viscérale ou kala-azar. Les nématodes du groupe des ascarides ont une affinité particulière pour le foie. Les larves des ascaris humains doivent traverser le parenchyme une fois au cours de leur cycle de développement, les larves des ascaris animaux au contraire migrent dans le foie pendant de plus longues périodes de temps. Les œufs des schistosomes sont transportés via le système porte dans le foie et emprisonnés dans les tissus. Un granulome inflammatoire se développe autour d’eux. Si la charge d’œufs est élevée, une fibrose du foie peut finalement se développer, entraînant une hypertension portale. Alors que les petites douves du foie (Clonorchis, Opisthorchis) vivant dans les voies biliaires font peu de mal au foie dans la plupart des cas, la plus grosse douve du foie Fasciola hepatica détruit le tissu hépatique au cours d’une phase de migration précoce de plusieurs semaines. Les cestodes larvaires du genre Echinococcus se trouvent généralement dans le foie sous forme de kystes fermés se développant par expansion (E. granulosus) ou de structures plus solides se développant par infiltration et destruction (E. multilocularis). La destruction se produit également si l’amibe (Entamoeba histolytica) envahit le foie. De grandes zones de nécrose, des abcès hépatiques se forment.
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