ArtikelJordtilstanden og udviklingen af promotorregionens direktionalitet

Eukaryote promotorregioner transkriberes ofte divergent in vivo, men det er ukendt, om de resulterende antisense-RNA’er er et mekanistisk biprodukt af RNA-polymerase II (Pol II) -transkription eller biologisk meningsfuld. Her bruger vi en funktionel evolutionær tilgang, der involverer spirende transkriptionskortlægning i S. cerevisiae-stammer indeholdende fremmed gær-DNA. Promotorregioner i fremmede miljøer mister den retningsbestemthed, de har i deres oprindelige art. Det er påfaldende, at tilfældige promotorregioner, der opstår i fremmed DNA, producerer lige transkription i begge retninger, hvilket indikerer, at divergerende transkription er et mekanistisk træk, der ikke indebærer en funktion for disse transkripter. Tilfældige promotorregioner, der opstår under evolution, fremmer tovejstranskription og over tid renses gennem mutation eller bevares for at muliggøre ny funktionalitet. Tilsvarende er human transkription mere tovejs i nyudviklede enhancere og promotorregioner. Således er promotorregioner iboende tovejs og er formet af evolution til forspændingstranskription mod kodning versus ikke-kodende RNA’er.