Artículo El estado fundamental y la evolución de la direccionalidad de la región promotora

Las regiones promotoras eucariotas se transcriben frecuentemente de forma divergente in vivo, pero se desconoce si los ARN antisentido resultantes un subproducto mecanicista de la transcripción de la ARN polimerasa II (Pol II) o biológicamente significativo. Aquí, utilizamos un enfoque evolutivo funcional que implica el mapeo de transcripciones nacientes en cepas de S. cerevisiae que contienen ADN de levadura extraño. Las regiones promotoras en ambientes extranjeros pierden la direccionalidad que tienen en sus especies nativas. Sorprendentemente, las regiones promotoras fortuitas que surgen en el ADN extraño producen una transcripción igual en ambas direcciones, lo que indica que la transcripción divergente es una característica mecanicista que no implica una función para estas transcripciones. Las regiones promotoras fortuitas que surgen durante la evolución promueven la transcripción bidireccional y, con el tiempo, se purgan mediante mutación o se retienen para permitir una nueva funcionalidad. De manera similar, la transcripción humana es más bidireccional en potenciadores y regiones promotoras de nueva evolución. Por lo tanto, las regiones promotoras son intrínsecamente bidireccionales y están moldeadas por la evolución para sesgar la transcripción hacia ARN codificantes versus no codificantes.