Artigo O Estado Fundamental e a Evolução da Direcionalidade da Região Promotora

As regiões promotoras eucarióticas são frequentemente transcritas de forma divergente in vivo, mas não se sabe se os RNAs antisense resultantes são um subproduto mecanístico da transcrição da RNA polimerase II (Pol II) ou biologicamente significativo. Aqui, usamos uma abordagem evolutiva funcional que envolve o mapeamento transcrito nascente em cepas de S. cerevisiae contendo DNA de levedura estranho. As regiões promotoras em ambientes estrangeiros perdem a direcionalidade que possuem em suas espécies nativas. Surpreendentemente, regiões promotoras fortuitas que surgem em DNA estranho produzem transcrição igual em ambas as direções, indicando que a transcrição divergente é uma característica mecanicista que não implica uma função para esses transcritos. As regiões promotoras fortuitas que surgem durante a evolução promovem a transcrição bidirecional e, ao longo do tempo, são eliminadas por mutação ou retidas para permitir uma nova funcionalidade. Da mesma forma, a transcrição humana é mais bidirecional em intensificadores e regiões promotoras recém-desenvolvidos. Assim, as regiões promotoras são intrinsecamente bidirecionais e são moldadas pela evolução para polarizar a transcrição em direção a RNAs codificantes versus não codificantes.